Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms