Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf5P56477 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf5P56477 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Irf5P56477 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf5P56477 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf5P56477 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf5P56477 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf5P56477 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf5P56477 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms