Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc1P34928 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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