Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Defa2P28309 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Defa2P28309 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms