Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2afxP27661 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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