Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms