Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cxcl13O55038 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Cxcl13O55038 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cxcl13O55038 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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