Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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