Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm5849J3QPE5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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