Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rnf148G3X9R7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rnf148G3X9R7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms