Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sh3tc1G3X9F6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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