Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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