Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prr29B1ARI9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.8 ms