Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprsB0V2N1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprsB0V2N1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprsB0V2N1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprsB0V2N1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprsB0V2N1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms