Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lcn6A2AJB9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms