Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms