Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Vav3Q9R0C8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vav3Q9R0C8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vav3Q9R0C8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vav3Q9R0C8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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