Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp11cQ9QZW0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms