Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChmQ9QXG2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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