Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rabgef1Q9JM13 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rabgef1Q9JM13 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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