Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smco4Q9JIS3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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