Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chmp4bQ9D8B3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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