Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syce1Q9D495 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syce1Q9D495 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Syce1Q9D495 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syce1Q9D495 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Syce1Q9D495 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Syce1Q9D495 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Syce1Q9D495 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Syce1Q9D495 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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