Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Syf2Q9D198 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms