Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Zbed3Q9D0L1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbed3Q9D0L1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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