Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrs1Q9CYH6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms