Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sgo1Q9CXH7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms