Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rab5aQ9CQD1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Rab5aQ9CQD1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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