Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg3Q9CPX6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atg3Q9CPX6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atg3Q9CPX6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms