Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rrbp1Q99PL5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms