Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup155Q99P88 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms