Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp16Q99LG0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp16Q99LG0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms