Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TrabdQ99JY4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms