Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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