Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Trim68Q8K243 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim68Q8K243 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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