Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Znf628Q8CJ78 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Znf628Q8CJ78 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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