Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm28Q8CGC6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm28Q8CGC6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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