Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx1Q8C8B0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx1Q8C8B0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx1Q8C8B0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Alx1Q8C8B0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Alx1Q8C8B0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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