Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ctdsp2Q8BX07 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms