Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem87bQ8BKU8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem87bQ8BKU8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms