Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg4bQ8BGE6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg4bQ8BGE6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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