Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms