Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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Smim19Q80ZU4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Smim19Q80ZU4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Smim19Q80ZU4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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