Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Topbp1Q6ZQF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms