Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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