Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms