Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BcanQ61361 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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BcanQ61361 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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BcanQ61361 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BcanQ61361 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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