Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf3Q60765 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms