Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Samhd1Q60710 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms