Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Chpf2Q3UU43 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Chpf2Q3UU43 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Chpf2Q3UU43 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms